DE NOVO
GENOME
신규 게놈 분석
Whole Genome De novo Assembly

Illumina 데이터를 기반으로 다양한 크기의 라이브러리를 제작합니다.

전처리 과정을 통해서 high quality 데이터를 확보하고, 다양한 de novo assembly 프로그램 (SOAPdenovo, Allpaths-LG, CLC Assembly Cell)을
이용하여 유전체 서열 조립 과정을 수행합니다.

Scaffolding과 gapclosing 과정을 거쳐 신규 유전체 서열 완성하게 됩니다.

Hybrid Genome Assembly

Construct high-quality reference genome using hybrid assembly approach.

“short contig size and many gaps”로 특징되어지는 기존 short read 기반
genome assembly의 문제점을 error correction된 long reads를 이용하여
gap을 줄이고 contig의 size를 증가시켜 완성도가 높은 high-quality reference
genome을 만들기 위한 파이젠의 genome solution입니다.

Gene Prediction &
Annotation Pipeline

완성된 신규 유전체와 RNA-Seq 데이터를 이용하여
유전자 위치를 예측하고 결정합니다.

정확한 유전자 위치 예측을 위해서 다양한 evidence 데이터를 활용하는 것이 중요합니다.

Send Us A Message

Complete any questions, questions and projects. Review and promised to hearing from you soon.