Hi-C 하이-C
In vivo Hi-C capture

세포안에서 염색체들은 보통 서로엉켜있는 상태로 존재하는데,
같은 염색체 끼리 서로 교차될 가능성이 높습니다.

Proximo Hi-C capture기술을 통해 세포 내에서
교차된 상태를 있는 그대로 추출하여 단편을 만들고
ligation하여 서열을 생산합니다.

Chromosome-scale scaffolding

Draft assembly 에 맵핑된 Hi-C read의 정보를 통해
두 유전자좌/컨티그 간의 근접도를 계산할 수 있습니다.

이런 구조적인 정보를 이용하여 컨티그들은 염색체 수준으로 조립됩니다.

Postclustering heatmap

Hi-C 정보를 이용하여 완성된 염색체 수준의
superscaffold의 linkage density heatmap 입니다.

같은 염색체 내에 강한 signal(Hi-C read들이 밀접하게 연관되어있음)을
확인할 수 있습니다.

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